Пољопривредни факултет као организациона јединица Универзитета у Источном Сарајеву, са три студијска програма: Пољопривреда, Шумарство и Агромедитернска производња је уз Правни факултет једини факултет који ради дислоцирано, на три локације: Источном Сарајеву, Бијељини, Власеници и Требињу. Сједиште Пољопривредног факултета смјештено је у згради Електротехничког факултета у Источном Сарајеву и обухвата површину око 1100 m2. 
Од 2010. године на захтјев града Бијељине, због исказане потребе и значаја Семберије за пољопривредну производњу отвара се одјељење Пољопривредног факултета у Бијељини, док се у 2011. години општина Власеница обраћа Универзитету у Источном Сарајеву и Пољопривредном факултету да се отвори студијски програм Шумарство, што је и реализовано. Од школске 2010/2011. године почело је са радом одјељење у Бијељини у оквиру зграде Центра за Високо образовање гдје се налазе канцеларије студентске службе и професора, док су се за наставни процес користили амфитеатар и учионице зграде одјељења Правног факултета у Бијељини.
У овој згради је направљен и лабораторијски простор за извођење вјежби (Хемија, Биологија, Микробиологија, Агрохемија и сродни предмети). Временом је Пољопривредном факултету обезбијеђен учионички простор и у Центру, па се данас већи дио наставног процеса организује у Центру за високо образовање. У Центру је студентима Пољопривредног факултета на располагању и кабинет за Информатику, као и библиотека и читаоница.
Студијски програм Шумарство, Пољопривредног Факултета у Источном Сарајеву почео је са радом школске 2011/2012 у Власеници у новоотвореној згради површине 2036 m2. У 2015. години и 2016. години у оквиру пројекта Модернизација универзитета сва три центра Пољопривредног факултета су опремљена модерним канцеларијским, учионичким и лабораторијским намјештајем.
Студијски програм Агромедитеранска производња Пољопривредног факултета почео је са радом школске 2022/23 године у згради унутар комплекса бивше касарне у Требињу, гдје се налази и Факултет за производњу и менаџмент. Овај студијски програм због оправданог назива у овом поднебљу буди велико интересовање ђацима тј. будућим студентима. 
За потребе студијског програма Агромедитеранска производња адаптиран је дио простора гдје су смјештене учионице и канцеларије студентске службе, а студентима је на располагању рачунарски кабинет, читаонице и библиотека.
